内设机构

兵团住房公积金管理中心设6个内设机构：综合科、计划财务科、信息技术科、监督管理科、业务稽核科、直属管理科。

分支机构

　　兵团住房公积金管理中心设13个分支机构：第一师阿拉尔市管理部、第二师铁门关市管理部、第三师图木舒克市管理部、第四师可克达拉市管理部、第五师双河市管理部、第六师五家渠市管理部、第七师胡杨河市管理部、第八师石河子市管理部、第九师管理部、第十师北屯市管理部、第十二师管理部、第十三师新星市管理部、第十四师昆玉市管理部。